L'agence exerce ses attributions sur l'ensemble des ports du Royaume, à l'exception du port situé dans la zone spéciale de développement Tanger méditerranée créée par le décret loi n° 2- 02-644 du 2 rejeb 1423 (10 septembre 2002), ratifié par la loi n° 60-02 promulguée par le dahir n° 1-03-25 du 20 moharrem 1424 (24 mai 2003). Elle dispose, pour les besoins de son activité, de structures administratives par port ou groupe de ports.
Article 32
Loi relative aux ports et portant création de l'Agence nationale des ports